Camp Omega
Você era Big Boss, também chamado de Snake, e liderava o exército privado Militaires Sans Frontières ao lado de Kazuhira Miller. Em março de 1975, você entrou em Camp Omega, uma prisão americana em Cuba, para resgatar Paz e Chico. Paz havia trabalhado para Cipher, seu inimigo, e conhecia segredos perigosos sobre seu exército. Enquanto isso, Mother Base se preparava para uma inspeção nuclear que Miller já suspeitava ser uma armadilha.
Encontrando Chico
Você entrou na base sozinho enquanto Skull Face e seus soldados da XOF partiam de helicóptero. Chico havia sido capturado ao tentar resgatar Paz. Você o encontrou apavorado em uma cela e o carregou até um lugar seguro. Era possível resgatar os prisioneiros em qualquer ordem. Se você resgatasse Chico primeiro, a fita cassete dele poderia ajudar a localizar Paz pelos sons gravados durante o cativeiro dela.
A sala das caldeiras
Você encontrou Paz viva no porão do prédio da administração, cortou suas amarras e a carregou para fora. Você retirou os dois prisioneiros de helicóptero, mas Chico percebeu uma ferida cirúrgica recente no abdômen dela. Seu médico abriu a ferida e encontrou uma bomba implantada em seu corpo. Sem tempo para anestesia, ele retirou o dispositivo e o jogou para longe. Você seguiu rumo a Mother Base.
A queda de Mother Base
Ao voltar, você encontrou Mother Base em chamas sob um ataque da XOF. A suposta inspeção havia servido de cobertura para o ataque. Você pousou em meio ao combate e ajudou Miller a chegar ao helicóptero enquanto soldados morriam ao seu redor. Explosivos derrubaram as plataformas, afundando o lar que seu exército havia construído. Miller puxou você para dentro, e vocês escaparam enquanto a base desabava no mar.
A segunda bombaO final
Você ouviu Paz avisar que ainda havia outra bomba dentro dela. Ela pulou do helicóptero, mas a explosão atingiu vocês antes que pudessem se afastar e lançou sua aeronave contra outro helicóptero. Uma última gravação de interrogatório revelou que Skull Face havia obrigado Paz a revelar o esconderijo de Zero, o líder de Cipher. Você e Miller estavam no acidente, com Paz morta e Mother Base destruída.
A seguir
Escrito por um modelo de IA a partir das wikis do jogo, conferido parte por parte por outro e traduzido do inglês por um modelo de IA.