Liberty Island
Vous étiez JC Denton, un agent récemment augmenté de la coalition antiterroriste des Nations unies, l'UNATCO. La peste grise se propageait et son traitement, l'Ambroisie, rare, était réservé aux puissants. À New York, vous avez poursuivi la NSF après qu'elle s'est emparée d'une cargaison. Votre frère Paul servait à vos côtés, jusqu'à ce que vous découvriez qu'il avait secrètement rejoint ceux que vous traquiez.
Changer de camp
Paul vous a appris que l'UNATCO servait la conspiration à l'origine de l'épidémie. Vous avez diffusé un signal de détresse de la NSF et êtes devenu une cible à votre tour. Vos choix déterminaient si Paul survivait à l'assaut contre son hôtel. Après votre capture, vous vous êtes réveillé dans une prison de Majestic 12, sous le siège de l'UNATCO. Le mystérieux Daedalus vous a aidé à fuir, mais vos employeurs avaient activé un dispositif de mise à mort dans votre corps.
Hong Kong
Vous avez fui à Hong Kong pour trouver Tracer Tong. Vous avez révélé le rôle de Maggie Chow dans un complot contre les triades de la ville et contribué à mettre fin à leur conflit. Tong a désactivé votre dispositif de mise à mort. Chez VersaLife, vous avez découvert des preuves que la peste grise était fabriquée et que son traitement était contrôlé par la même conspiration. Vous avez détruit un constructeur universel utilisé pour produire la maladie.
Retour à New York
Vous êtes retourné à New York et avez rencontré Stanton Dowd, des Illuminati. Il vous a dirigé vers le PRCS Wall Cloud, aux chantiers navals de Brooklyn. Vous avez coulé le cargo, détruisant sa cargaison de peste grise avant que Majestic 12 puisse la répandre à travers l'Amérique. Dowd vous a ensuite envoyé auprès de ses contacts Illuminati à Paris.
Paris
Vous avez poursuivi Majestic 12 jusqu'à Paris, où la résistance de Silhouette vous a mené à Nicolette DuClare. Grâce aux relations de sa mère, vous avez contacté Morgan Everett, des Illuminati. Vous avez accédé à l'ordinateur de la cathédrale des Templiers pour lui permettre de terminer un remède contre la peste grise. Everett vous a expliqué comment Bob Page avait pris le contrôle de Majestic 12 et utilisé l'épidémie pour gagner du pouvoir. Il voulait rétablir la domination des Illuminati.
La zone 51
Vous avez défendu les scientifiques de Gary Savage à Vandenberg, où les intelligences artificielles Daedalus et Icarus ont fusionné pour former Helios. Page comptait fusionner avec Helios pour dominer les communications mondiales. Pour fabriquer le remède d'Everett, Savage avait besoin d'un constructeur universel fonctionnel. Vous avez récupéré les plans d'un laboratoire sous-marin pour l'achever. Quand Page a visé Vandenberg avec un missile nucléaire, vous l'avez redirigé vers son bastion de la zone 51, puis vous l'y avez suivi.
Votre dernier choixLa fin
Vous avez rejoint Page dans la zone 51 et décidé comment mettre fin à sa tentative de prise de pouvoir. L'issue dépendait de vous. Suivre Tong signifiait détruire le complexe et les communications mondiales, plongeant le monde dans un âge sombre technologique. Le plan d'Everett impliquait de tuer Page et de rejoindre le pouvoir secret des Illuminati. Helios proposait une fusion qui ferait de vous une partie d'une nouvelle intelligence gouvernant l'humanité. Vous avez arrêté Page, mais choisi ce qui lui succéderait.
Ensuite
Écrit par un modèle d'IA à partir des wikis du jeu, vérifié partie par partie par un autre, et traduit de l'anglais par un modèle d'IA.