Liberty Island
Eras JC Denton, un agente recién aumentado de la Coalición Antiterrorista de las Naciones Unidas, UNATCO. La epidemia de la Muerte Gris se extendía y su escaso tratamiento, Ambrosía, estaba reservado para los poderosos. En Nueva York, perseguiste a la NSF después de que se apoderara de un cargamento. Tu hermano Paul trabajaba a tu lado, hasta que descubriste que se había unido en secreto a quienes perseguías.
El cambio de bando
Paul te reveló que UNATCO servía a la conspiración responsable de la epidemia. Emitiste una señal de socorro de la NSF y te convertiste también en un objetivo. Tus decisiones determinaron si Paul sobrevivía al asalto a su hotel. Tras ser capturado, despertaste en una prisión de Majestic 12 bajo la sede de UNATCO. El misterioso Daedalus te ayudó a escapar, pero tus empleadores habían activado un mecanismo letal dentro de tu cuerpo.
Hong Kong
Huiste a Hong Kong para encontrar a Tracer Tong. Expusiste la participación de Maggie Chow en una conspiración contra las tríadas de la ciudad y ayudaste a poner fin a su enfrentamiento. Tong desactivó tu mecanismo letal. Dentro de VersaLife, descubriste pruebas de que la Muerte Gris era artificial y de que la misma conspiración controlaba su tratamiento. Destruiste un constructor universal usado para producir la enfermedad.
El regreso a Nueva York
Regresaste a Nueva York y te reuniste con Stanton Dowd, de los Illuminati. Te dirigió al PRCS Wall Cloud, en los astilleros navales de Brooklyn. Hundiste el carguero y destruiste su cargamento de Muerte Gris antes de que Majestic 12 pudiera propagarla por Estados Unidos. Dowd te envió entonces a buscar a sus contactos Illuminati en París.
París
Seguiste a Majestic 12 hasta París, donde la resistencia de Silhouette te condujo hasta Nicolette DuClare. Gracias a los contactos de su madre, te comunicaste con Morgan Everett, de los Illuminati. Accediste a la computadora de la catedral de los Caballeros Templarios para que él pudiera terminar una cura para la Muerte Gris. Everett explicó cómo Bob Page se había apoderado de Majestic 12 y había usado la epidemia para ganar poder. Su objetivo era devolver el control a los Illuminati.
Área 51
Defendiste a los científicos de Gary Savage en Vandenberg, donde las inteligencias artificiales Daedalus e Icarus se fusionaron en Helios. Page planeaba fusionarse con Helios y dominar las comunicaciones mundiales. Para fabricar la cura de Everett, Savage necesitaba un constructor universal operativo. Recuperaste los planos de un laboratorio submarino para completarlo. Cuando Page apuntó un misil nuclear contra Vandenberg, lo redirigiste hacia su fortaleza del Área 51 y luego lo seguiste hasta allí.
Tu decisión finalEl final
Llegaste hasta Page en el Área 51 y decidiste cómo poner fin a su intento de hacerse con el control. El desenlace dependía de ti. Seguir a Tong significaba destruir las instalaciones y las comunicaciones mundiales, sumiendo al mundo en una edad oscura tecnológica. El plan de Everett suponía matar a Page y unirte al gobierno secreto de los Illuminati. Helios te ofrecía una fusión que te convertiría en parte de una nueva inteligencia al mando de la humanidad. Acabaste con las aspiraciones de Page, pero elegiste qué las sustituiría.
Lo siguiente
Escrito por un modelo de IA a partir de las wikis del juego, comprobado con ellas parte por parte por otro, y traducido del inglés por un modelo de IA.