O Syndicate
Você era o chefe dos Third Street Saints, que agora eram celebridades com um império criminoso. Um assalto a banco colocou você, Shaundi e Johnny Gat nas mãos do Syndicate de Phillipe Loren. Você se recusou a entregar seus negócios. Você e Shaundi escaparam do avião dele sobre Steelport, mas Gat foi perdido na luta.
A torre de Loren
Você se reuniu com Pierce e atacou os negócios do Syndicate em Steelport. Dentro da torre de Loren, libertou Oleg, cujo corpo havia sido usado para criar os clones gigantescos da gangue. Você esmagou Loren sob o contrapeso de um elevador. Destruir ou preservar a torre era uma escolha sua. Quando os Luchadores de Killbane emboscaram o cortejo fúnebre de Gat, você voltou para terminar de desmantelar o Syndicate.
Novos aliados
Você recrutou a hacker Kinzie Kensington, o cafetão Zimos e o lutador Angel de la Muerte para enfrentar as gangues restantes do Syndicate. Killbane assumiu o comando e assassinou Kiki DeWynter; a irmã dela, Viola, acabou se juntando a você contra ele. Enquanto isso, a senadora Monica Hughes enviou a força militar STAG para Steelport. Seu comandante, Cyrus Temple, transformou sua guerra de gangues numa ocupação.
Guerra virtual
Você deixou Kinzie enviar você para dentro da rede de computadores dos Deckers, onde derrotou o avatar de Matt Miller. Você poupou Matt, que abandonou o Syndicate e deixou Steelport. Contra a STAG, você lutou para defender sua sede e manteve o ator Josh Birk como moeda de troca. Entregá-lo ou mantê-lo com os Saints ficava a seu critério; Cyrus atacava o prédio de qualquer maneira.
Uma cidade sitiada
Você se passou por Cyrus para resgatar Shaundi do porta-aviões da STAG e depois o destruiu. Um ataque posterior a um voo de carga libertou zumbis em Arapice Island. Você conteve o surto e escolheu entre destruir ou guardar o vírus que restava. Com Angel, também desafiou Killbane no Murderbrawl e o derrotou no ringue. Tomar ou não a máscara dele era uma escolha sua.
Confronto triplo
Você lutou em meio a uma batalha entre a STAG e os Luchadores que tomou a cidade inteira. Então duas ligações obrigaram você a escolher. Killbane estava escapando pelo aeroporto. Kia, uma oficial da STAG, havia aprisionado Shaundi, Viola e o prefeito Burt Reynolds no monumento da cidade, planejando explodi-lo e culpar os Saints. Você precisava escolher entre perseguir Killbane e salvar os reféns.
Seu finalO final
Se salvasse os reféns, você matava Kia, mas Killbane escapava. Os Saints eram aclamados como heróis, a STAG se retirava, e você terminava filmando Gangstas in Space. Se perseguisse Killbane, você o matava, mas Shaundi, Viola e Reynolds morriam na explosão. Depois, você destruía o porta-aviões voador Daedalus da STAG e matava Cyrus. Você declarava Steelport uma cidade-estado independente sob o comando dos Saints e oferecia a Pierce o cargo de prefeito. Sua última escolha determinava quem compartilhava sua vitória.
A seguir
Escrito por um modelo de IA a partir das wikis do jogo, conferido parte por parte por outro e traduzido do inglês por um modelo de IA.